Liên quan đến vụ án, ông Nguyễn Tuấn Quỳnh (nguyên Chủ tịch HĐTV Công ty Long Hưng) bị xét xử về tội Đưa hối lộ. Bị cáo Trần Trác Việt Đức (cựu Giám đốc Công ty Bách Khoa Việt) và Đỗ Thị Tuyết Nga (cựu Kế toán trưởng Công ty Bách Khoa Việt) bị xét xử về tội Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí.
Vụ việc bắt đầu từ lá đơn tố giác của bà Trần Thị Loan Phương (Chủ tịch HĐQT Công ty Bách Khoa Việt). Thời điểm cuối năm 2012, nữ đại gia tên Phương quen ông Nguyễn Lộc An.
Đầu năm 2015, Công ty Bách Khoa Việt có văn bản đề nghị Bộ Công Thương cấp giấy phép thương nhân phân phối xăng dầu. Thời điểm đó, Bộ Công Thương có quyết định giao ông Nguyễn Lộc An làm Trưởng đoàn kiểm tra điều kiện cấp giấy phép thương nhân phân phối xăng dầu của Công ty Bách Khoa Việt.
Bà Phương đã gặp ông An, đưa cho cựu Phó vụ trưởng 200 triệu đồng kèm lời đề nghị được giúp đỡ để Công ty Bách Khoa Việt được cấp giấy phép. Ngày 4/2/2015, Công ty Bách Khoa Việt được Bộ Công Thương cấp giấy xác nhận đủ điều kiện làm thương nhân xăng dầu.
Khoảng tháng 8/2015, bà Phương đến nhà ông An ở Hà Nội nhờ giúp Công ty Bách Khoa Việt được làm thương nhân đầu mối kinh doanh xuất khẩu, nhập khẩu xăng dầu. Khi đó, ông An đồng ý và nói cứ làm đi, bị cáo sẽ giúp. Tại cuộc gặp này, ông An nói rằng mình đang có ý định mua căn nhà to hơn nhưng chưa đủ tiền và gợi ý bà Phương “hỗ trợ” tiền mua nhà.
Đến đầu tháng 9/2015, ông An chủ động gọi điện đề nghị bà Phương “hỗ trợ” 9 tỷ đồng để mua nhà, dặn bà Phương chuyển tiền vào tài khoản của vợ ông. Sau đó, 9 tỷ đồng đã được chuyển vào tài khoản theo đúng ý của cựu phó vụ trưởng.
Đến ngày 9/9/2023, bà Phương đã chủ động làm đơn tố giác việc ông Nguyễn Lộc An nhận hối lộ và tích cực hợp tác với CQĐT làm rõ bản chất vụ án.
VKSND Tối cao cho rằng, hành vi của bà Trần Thị Loan Phương là đưa hối lộ. Tuy nhiên, khi hành vi chưa bị phát giác, bà Phương đã nhận thức được sai phạm nên chủ động làm đơn tố giác việc ông Nguyễn Lộc An nhận hối lộ. Bà Phương đã thành khẩn khai báo, ăn năn hối cải, tích cực hợp tác với CQĐT làm rõ bản chất vụ án.
Trên cơ sở tố giác của bà Phương, CQĐT đã thu thập đủ chứng cứ và khởi tố ông An. Căn cứ quy định tại BLHS và Nghị quyết 03 của Hội đồng thẩm phán TAND Tối cao, CQĐT miễn trách nhiệm hình sự đối với bà Phương nhưng tịch thu toàn bộ số tiền 9,2 tỷ đồng sung công quỹ.
Theo cáo buộc, từ tháng 1-9/2015, ông Nguyễn Lộc An đã lợi dụng chức vụ, quyền hạn của mình là Trưởng Đoàn kiểm tra điều kiện cấp giấy phép kinh doanh xăng dầu đối với Công ty Bách Khoa Việt và Công Long Hưng để nhận hối lộ.
Ông Nguyễn Lộc An biết rõ Công ty Bách Khoa Việt và Công ty Long Hưng không đủ điều kiện được cấp giấy phép kinh doanh xuất khẩu, nhập khẩu xăng dầu nhưng với động cơ cá nhân, bị cáo đã chủ động gợi ý nhận tiền để hợp thức các thủ tục có điều kiện cho 2 công ty trên.
Ngoài số tiền 9,2 tỷ đồng nhận của bà Trần Thị Loan Phương, cựu Phó vụ trưởng còn nhận 5 tỷ đồng của ông Nguyễn Tuấn Quỳnh để tạo điều kiện cho Công ty Bách Khoa Việt được cấp giấy xác nhận đủ điều kiện làm thương nhân phân phối xăng dầu và giấy phép kinh doanh xuất khẩu, nhập khẩu xăng dầu trái quy định.
Vợ chồng ông An đã dùng 14 tỷ đồng để mua căn biệt thự ở quận Tây Hồ, Hà Nội để ở. Số tiền 200 triệu đồng còn lại, bị cáo An dùng chi tiêu ăn uống, sinh hoạt cá nhân hết.
Trong vụ Xuyên Việt Oil, ông Nguyễn Lộc An bị cáo buộc nhận từ Giám đốc Công ty Xuyên Việt Oil 400 triệu đồng cùng chiếc đồng hồ hiệu Patek Philippe. Với cáo buộc nhận hối lộ, tháng 11/2024, ông An bị TAND TPHCM tuyên phạt mức án 4 năm tù.
Đến ngày 12/5, TAND Cấp cao tại TPHCM cho rằng không có cơ sở xem xét giảm nhẹ hình phạt cho ông An do bị cáo giữ vai trò tích cực trong việc cấp giấy phép kinh doanh cho Công ty Xuyên Việt Oil, gây hậu quả đặc biệt nghiêm trọng.
Năm 2002, ông Nguyễn Lộc An bị TAND tỉnh Lạng Sơn xét xử và tuyên phạt mức án 3 năm tù nhưng cho hưởng án treo về tội Trốn thuế, theo Điều 161 Bộ luật Hình sự năm 1999. Sau đó, tòa phúc thẩm tuyên y án.
